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Je suis maître de conférence en informatique à l'Université de Nantes, site de la faculté des sciences. Je suis rattaché au LINA (Laboratoire d'informatique de Nantes Atlantique), et membre associé à l'équipe-projet DyLISS (IRISA/INRIA Rennes-Bretagne-Atlantique) à Rennes.

Recherches (plus de détails ici)

Mes recherches portent sur l'utilisation de méthodes probabilistes en bio-informatique. Je m'intéresse plus particulièrement à deux types de problèmes

  1. des problèmes d'extraction et de recherche de motifs.
  2. des problèmes issus de la biologie des systèmes.

Responsabilités (plus de détails ici)

Encadrements de thèse (plus de détails ici)

J'ai co-encadré en thèse Solenne Carat (co-encadrement 50% avec Rémi Houlgatte, INSERM U915) autour de l'inférence de réseaux de régulation à partir d'une combinaison de données de transcription et de ChIP-chip pour étudier le cancer du sein. J'encadre actuellement en thèse Vincent Picard (co-encadrement 50% avec Anne Siegel, DyLISS), Marko Budinich (co-encadrement 40% avec D. Eveillard et Bruno Saint-Jean) et Hanen Mhamdi (co-encadrement 30% avec A. Larlhimi et M. Elloumi, thèse en co-tutelle avec la Tunisie).

Projets (plus de détails ici)

Contact

Jérémie Bourdon,

LINA, Université de Nantes, 2, rue de la Houssinière, 44322 Nantes Cedex

Tel : (+33) 2 51 12 58 25

Jeremie.Bourdon at univ-nantes.fr